گروه گیاهپزشکی مشتمل بر 7 آزمایشگاه تحقیقاتی در زمینه های آفات و بیماریهای گیاهی می باشد. در این آزمایشگاه ها دانشجویان تحصیلات تکمیلی مشغول گذراندن پایان نامه های خود در زمینه های زیر می باشند.
شناسایی آفات کشاورزی و راههای مبارزه با آنها (روشهای شیمیایی و بیولوژیک)
شناسایی نماتدهای گیاهی و روشهای مبارزه با آنها
شناسایی و تعامل قارچهای گیاهی با گیاه میزبان
شناسایی و تعامل پروکاریوتهای بیماریزای گیاهی با گیاه میزبان
شناسایی بیماریهای ویروسی گیاهان
شناسایی کنه های گیاهی و روشهای مبارزه با آنها